Sesuai amanat dalam Peraturan Menteri Perhubungan RI Nomor 81 tahun 2020 tentang Statuta Politeknik Perkeretaapian Indonesia Madiun, Satuan Penjaminan Mutu mempunyai tugas melakukan dokumentasi, pemeliharaan, pengendalian dan pengembangan sistem penjaminan mutu. Mengacu pada Permendikbudriset No. 53 Tahun 2023 tentang Penjaminan Mutu Pendidikan Tinggi, evaluasi pemenuhan standar pendidikan tinggi perlu dilaksanakan secara berkala. Untuk mengukur tingkat kesesuaian antara penyelenggaraan Politeknik Perkeretaapian Indonesia Madiun dengan Standar Pendidikan Tinggi, dilakukan evaluasi pelaksanaan Standar Mutu Politeknik Perkeretaapian Indonesia Madiun melalui audit mutu internal. Standar mutu yang ditetapkan Politeknik Perkeretaapian Indonesia Madiun berpedoman pada Undang-Undang Nomor 20 Tahun 2003 tentang Sistem Pendidikan Nasional (SPN) Bab IX Pasal 35.

Politeknik Perkeretaapian Indonesia Madiun telah menetapkan Pedoman Audit Mutu Internal melalui Surat Keputusan Direktur Politeknik Perkeretaapian Indonesia Madiun Nomor SK-PPIM 633 Tahun 2022 sebagai pedoman auditor dalam menjalankan audit mutu internal. Audit mutu internal tahun 2024 dilaksanakan pada 10 s.d 13 Desember 2024 berdasarkan SK Direktur Politeknik Perkeretaapian Indonesia Madiun Nomor SK-PPIM 563 Tahun 2024 tanggal 2 Desember 2024 tentang Penetapan Tim Audit Mutu Internal Politeknik Perkeretaapian Indonesia Madiun Tahun 2024 dan Surat Tugas Kegiatan Audit Mutu Internal Nomor ST-PPIM 806 Tahun 2024 tanggal 5 Desember 2024.